Både dominikanerna och franciskanerna hade nunnekloster. Dessa kloster var mer slutna anläggningar än brödernas konvent. (Vill du veta mer om klosterliv och klosterorganisation, se under rubrikerna kloster och tiggarordnar) I Kalmar fanns under medeltiden ett dominikanskt nunnekloster. Den dagliga mässan leddes av en broder från tiggarkonventet eller en av stadens präster. Franciskanernas nunnor kallas klarissor efter den heliga Klara, en av Franciscus följeslagare. Bland annat i Stockholm har det funnits ett franciskanskt nunnekloster.